Funktionelle Analyse der Wechselwirkungen von antimikrobiellen Peptiden mit methanogenen Archaeen und die Antwort des angeborenen Immunsystems auf Archaea| Projektleitung: | Prof. Dr. rer. nat. Ruth Schmitz-Streit | | Beteiligte: | Dr. rer. nat. Anke Schilhabel, Dr. rer. nat. Corinna Bang, Dr. rer. nat. Katrin Weidenbach | | Förderer: | Deutsche Forschungsgemeinschaft | Mitwirkende
Institutionen: |
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| LG Biophysik, Forschungszentrum Borstel | | Biochemisches Instiut der Christian-Albrechts-Universität Kiel | | Institut für Klinische Molekularbiologie des Universitätsklinikum Schleswig-Holstein (UKSH) | | Stichwörter: | antimikrobielle Peptide; menschlicher Darm; methanogene Archaeen; angeborenes Immunsystem | | Beginn: | 1.3.2010 | | Inhalt und Ziele: | Als Bestandteil der anaeroben Mikroflora des menschlichen Darms sind methanogene Archaeen in der Lage, die mikrobielle Homöostase zu beeinflussen. In diesem Zusammenhang wurde jedoch eine wechselseitige Beeinflussung des angeborenen Immunsystems durch Archaeen bisher nicht hinterfragt. Daher ist es Ziel des Projektes, den Wirkmechanismus von antimikrobiellen Peptiden auf methanogene Archaeen aus dem Darm, sowie die angeborene Immunantwort auf Archaeen zu untersuchen.
| | Kontakt: | Schmitz-Streit, Ruth
Telefon +49 431 880-4334, Fax +49 431 880-2194, E-Mail: rschmitz@ifam.uni-kiel.de
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Identifikation und funktionelle Analyse regulatorischer RNAs im Archaeon Methanosarcina mazei mit besonderem Hinblick auf Stickstoff- und allgemeiner Stress-Antwort| Projektleitung: | Prof. Dr. rer. nat. Ruth Schmitz-Streit | | Beteiligte: | Dr. rer. nat. Katrin Weidenbach, Dr. rer. nat. Dominik Jäger, Rebecca DeSantis | | Förderer: | Deutsche Forschungsgemeinschaft; Schwerpunktprogramm SPP 1258 (Sensorische und regulatorische RNAs in Prokaryoten) | | Stichwörter: | nicht-kodierende kleine RNAs; Methanosarcina mazei; Regulation des N-Metabolismus; Methylamin-Stoffwechsel | | Beginn: | 1.7.2007 | | Inhalt und Ziele: | Im Fokus des Projektes steht die Rolle von nicht-kodierenden RNAs in der Stressantwort des methanogenen Archaeon Methanosarcina mazei. Neben der genomweiten Identifizierung von nicht kodierenden RNAs (ncRNAs) mittels unterschiedlicher Ansätze werden einzelne Kandidaten und deren Regulations-
mechanismen im Detail studiert. Dabei konzentrieren wir uns auf solche, die in der Beantwortung des Stickstoff-, Sauerstoffstress oder generellen Stress involviert sind; sowie in der Regulation der Expression von Methylamin-Methyltransferasen. Ziel ist es, die Rolle von regulatorischen RNAs in M. mazei aufzudecken und ihre Funktion in der generellen Stressantwort zu identifizieren.
| | Kontakt: | Schmitz-Streit, Ruth
Telefon +49 431 880-4334, Fax +49 431 880-2194, E-Mail: rschmitz@ifam.uni-kiel.de
| | Publikationen: | - Ehlers, C. ; Weidenbach, K. ; Veit, K. ; Deppenmeier, U. ; Metcalf, W. ; Schmitz, R. A.:
Development of genetic methods and construction of chromosomal glnK1 mutant in Methanosarcina mazei strain Gö1
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In: Mol. Genet. Genomics 273 (2005), S. 290-298 - Ehlers, C. ; Weidenbach, K. ; Veit, K. ; Forchhammer, K. ; Schmitz, R. A.:
Unique mechanistic features of post translational regulation of glutamin synthetase activity in Methanosarcina mazei in response to nitrogen availability
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In: Mol. Microbiol. 55 (2005), S. 1841-1854 - Veit, K. ; Ehlers, C. ; Ehrenreich, A. ; Salmon, K. ; Hovey, R. ; Gunsalus, R. P. ; Deppenmeier, U. ; Schmitz, R. A.:
Global transcriptional analysis under different nitrogen availabilities
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In: Mol. Genet. Genomics 267 (2006), S. 41-55 - Weidenbach, K. ; Glöer, J. ; Ehlers, C. ; Sandmann, K. ; Reeve, J. ; Schmitz, R. A.:
Deletion of the archaeal histone in Methanosarcina mazei Gö1 results in reduced growth and genomic transcription
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In: Mol. Microbiol. 67 (2008), S. 662-671 - Jäger, D. ; Sharma, C.M. ; Thomsen, J. ; Ehlers, C. ; Vogel, J. ; Schmitz, R. A.:
Deep sequencing analysis of the Metnanosarcina mazei Gö1 transcriptome in response to nitrogen availability
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In: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106 (2009), Nr. 51, S. 21878-21882
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