Dr. Stefanie Böhnke-Brandt

Geomikrobiologie
Forschungsbereich 2: Marine Biogeochemie
FE Marine Geosysteme

Büro:
Büro: 12-339
Telefon: +49 431 600-1234
E-Mail: sboehnke-brandt@geomar.de

Anschrift:
Wischhofstraße 1-3
D-24148 Kiel

Forschungsinteressen

Kohlenstofffixierende Enzyme (CCE - carbon capturing enzymes)
Entdeckung neuartiger Enzyme (RubisCO und CODHs) | Funktional Metagenomik | Erschließung und Nutzung von nicht kultivierten Mikroorganismen und deren enzymatischem Potential

Ökologie mikrobieller Sedimentgemeinschaften
Biogeochemische Stoffkreisläufe | Abiotische-Biotische Interaktionen | Marines Mikrobiom (Metagenomik, Metatranskriptomik)

Mikroben im Klimawandel
Alkalinitätserhöhung im Meer | Ausdehnung von Sauerstoffminimumzonen

Mikroben Gemeinschaften an hydrothermal beeinflussten Systemen
Bedeutung von Mikroorganismen für die Bildung von Fe-Liganden | Inkubationsexperimente

Aktuelle Projekte

AI MareExplore: Utilizing AI for marine enzyme discovery to address human-made grand challenges (Helmholtz Innovation Pool Projekt, PI, 2025-2027)

RETAKE II: CO2-Entnahme durch Erhöhung der Alkalinität: Potenzial, Nutzen und Risiken: Teilprojekt 1.4: Verstärkte benthische Verwitterung von Karbonat und Olivin in der Ostsee - Phase 2 (Assoziierte Wissenschaftlerin, RETAKE-2, BMBF)

DOME: Einfluss von Mikroben auf die Bildung, Umwandlung und Auflösung von Massiven Sulfiden am Meeresboden (SMS) DFG Schwerpunktprogramm “Dynamics of Ore Metals Enrichment – SPP 2238
(Co-Supervision, 2023 - 2025)

ECO2nvert: Elektroenzymatische CO2-Reduktion unter Verwendung rekombinanter CODHs aus Lebensräumen am Meeresboden, die mittels eines aktivitätsbasierten Screenings gefunden werden (Co-PI, PTJ 2020 - 2023)

Wissenschaftlicher Werdegang

seit 06/2022
Wissenschaftlerin am GEOMAR Helmholtz-Zentrum für Ozeanforschung Kiel (Geomikrobiologie)

seit 01/2018*
Postdoc am GEOMAR Helmholtz-Zentrum für Ozeanforschung Kiel (Geomikrobiologie)

2015-2017*
Postdoc an der Universität Hamburg (Molecular Biology of Microbial Consortia)

2010-2014
PhD an der Universität Hamburg (Molecular Biology of Microbial Consortia): „A novel function-based screen for detecting RubisCO active clones from metagenomic libraries: elucidating the role of RubisCO associated enzymes“ (Supervisor: Prof. Dr. Mirjam Perner)

2010
Diplom (M. Sc. Äquivalent) in Mikrobiologie, Genetik und Jura (Strafrecht), Universität Hamburg

2009-2010
Diplomarbeit an der Universität Hamburg (Mikrobiologie und Biotechnologie): “Untersuchungen zur Struktur und Dynamik Ammoniak oxidierender Populationen in tidebeeinflussten Lebensräumen der Elbe“ (Supervisor: PD A. Pommerening-Röser)

2005-2009
Studium der Biologie an der Universität Hamburg

*Elternzeit 2016 und 2019

GEOMAR interne Gremienarbeit und Engagements

  • seit 2024 Mitglied Schwerpunktteam 'Etablierung der elektronischen Zeiterfassung'
  • seit 2024 Kommissionsmitglied Helmholtz-Akademie
  • seit 2023 Kommissionsmitglied Inge-Lehmann Fonds
  • seit 2023 Personalrätin
  • von 2021-2023 Postdoc-Vertreterin im Gender and Equality Board
  • von 2021-2023 Postdoc-Vertreterin im Women's Executive Board
  • von 2021-2023 Postdoc-Vertreterin im Wissenschaftlicher Rat
  • seit 2021 Vorsitzende der Kommission für Biologische Sicherheit nach §29 (1) GenTSV
  • seit 2021 Beauftragte für Biologische Sicherheit (BBS)
  • seit 2021 Evakuierungshelferin
  • seit 2018 Ersthelferin
  • seit 2018 Projektleiter nach §15 (2) GenTSV

Wissenschaftliche Engagements

Lehre

  • seit 2020 Dozentin in den Modulen MSc Biologische Ozeanographie (MNF-bioc-101) und MSc Geowissenschaften (MNF-geow-103), GEOMAR
  • jährlich seit 2020, Planung und Betreung, Blockkurse für Masterstudierende (MNF-bioc-379 und MNF-bioc-202), inkl.Tagesausfahrt, Seminar, Vorlesung und Praktikum, GEOMAR
  • jährlich von 2012 bis 2015 Planung und Betreuung, Blockkurs, funktioneller Metagenomik für Masterstudierende, inkl. Seminar und Praktikum, Universität Hamburg
  • seit 2010 fachliche Betreuung von Techniker*innen, Praktikant*innen, Auszubildenden, Bachelore- und Masterstudierenden und Doktorand*innen

Stipendium

2010-2013
Promotionsstipendium der Graduierten Schule C1-Chemistry in Resource and Energy Management (C1-REM), gefördert durch die Landesexzellenzinitiative (Lexi) Hamburg

Publikationen

Gebert, J., Böhnke, S., Bergmann, L., Krohn, I., und Perner, M. Linking microbial community composition, microbial biomass and extrapolymeric substances to organic matter lability gradients in sediments of the tidal Elbe. (in Preparation)

Bährle, R. J., Baaske, R., Bornemann, T. L. V., Fuhr, M., Böhnke, S., Soares, A., Dale, A. W. , Probst, A. J., Geilert, S. und Perner, M. (Submitted) Calcite addition to surface sediments as a CDR strategy in seasonal hypoxic coastal waters promotes cable bacteria and changes element cycling. ISME Communications: New Developments in Microbial Ecology

Laufer-Meiser, K., Alawi, M., Böhnke, S., Solterbeck, C.H., Schloesser, J., Schippers, A., Dirksen, P., Bruser, T., Henkel, S., Fuss, J., and Perner, M. (2024). Oxidation of sulfur, hydrogen, and iron by metabolically versatile Hydrogenovibrio from deep sea hydrothermal vents. The ISME Journal 18(1). doi.org/10.1093/ismejo/wrae173

Bährle, R., Böhnke, S., Englhard, J., Bachmann, J., and Perner, M. (2023). Current status of carbon monoxide dehydrogenases (CODH) and their potential for electrochemical applications. Bioresour Bioprocess 10(1), 84.

Fuhr, M., Wallmann, K., Dale, A.W., Diercks, I., Kalapurakkal, H.T., Schmidt, M., Sommer, S., Böhnke, S., Perner, M., and Geilert, S. (2023). Disentangling artificial and natural benthic weathering in organic rich Baltic Sea sediments. Frontiers in Climate 5. doi.org/10.3389/fclim.2023.1245580

Perner, M., Wallmann, K., Adam-Beyer, N., Hepach, H., Laufer-Meiser, K., Böhnke, S., Diercks, I., Bange, H.W., Indenbirken, D., Nikeleit, V., Bryce, C., Kappler, A., Engel, A., and Scholz, F. (2022). Environmental changes affect the microbial release of hydrogen sulfide and methane from sediments at Boknis Eck (SW Baltic Sea). Frontiers in Microbiology 13. doi.org/10.3389/fmicb.2022.1096062

Hansen, C., Kleint, C., Böhnke, S., Klose, L., Adam, N., Sass, K., Perner, M., Dittmar, T. & Koschinsky, A. (2022) Impact of variable Fe concentrations on Fe-binding ligands, dissolved organics and microbial communities in hydrothermal plumes – an experimental study. Scientific Reports 12(1), 20723. doi.org/10.1038/s41598-022-25320-0

Böhnke, S. & Perner, M. (2022) Approaches to unmask functioning of the uncultured microbial majority from extreme habitats on the seafloor. Frontiers in Microbiology 29;13:845562. doi: 10.3389/fmicb.2022.845562

Böhnke, S. & Perner, M. (2019) Seeking active RubisCOs from the currently uncultured microbial majority colonizing deep-sea hydrothermal vent environments. The ISME Journal 13, 2475-2488. doi: 10.1038/s41396-019-0439-3

Böhnke, S., Sass, K., Gonnella, G., Diehl, A. Kleint, C., Bach, W., Zitoun, R., Koschinsky, A., Indenbirken, D., Sander, S. G., Kurtz, S., and Perner, M. (2019) Parameters Governing the Community Structure and Element Turnover in Kermadec Volcanic Ash and Hydrothermal Fluids as Monitored by Inorganic Electron Donor Consumption, Autotrophic CO2 Fixation and 16S Tags of the Transcriptome in Incubation Experiments, Frontiers in Microbiology, 10: 2296. doi: 10.3389/fmicb.2019.02296


>>>> Eine vollständige Liste der Publikationen finden Sie hier: OceanRep

Ausgewählte nationale und internationale Konferenzbeiträge

Böhnke, S*. Bährle, R., Dirksen, P., Alawi, M., and Perner, M. (2024) Poster @ the GRC on Microbial One Carbon Metabolism: Mining  novel  CODHs  through  culture-independent  functional  metagenomic
screening (Bosten, USA)

Böhnke, S*, Zarzycki, J., Bährle, R., Scheffen, M., Engelhard, J., Paczia, N., Bachmann, J., Erb, T. and Perner, M. (2024) Talk @ Goldschmidt conference: Tapping into the unknown: Functional screening for CO2 reducing enzymes gives unprecedented insights into the uncultured microbial majority (Lyon, France)

Böhnke, S*. and Perner, M. (2022) Invited Talk @ the GRS on Microbial One Carbon Metabolism: Glimpses into microbial dark matter proteins uncover novel ribulose-1,5-bisphosphate converting enzyme  (Bosten, USA)

Böhnke, S*. and Perner, M. (2022) Poster Presentation and Poster Pitch Talk @ GRC Marine Microbes: Diving into the ocean’s microbial dark matter: from sensor triggered sampling and activity-based enzyme searches (Les Disablerets, Switzerland)

Hansen, C., Kleint, C., Böhnke, S*., Klose, L., Adam-Beyer, N., Sass, K., Dittmar, T., Koschinsky, A., and Perner, M. (2022) e-poster Presentation @ VAAM 2022:  Iron amendment to hydrothermal plumes induces shifts in microbial communities and provide first insights into the microbial organic iron-ligand production (Online Konferenz).

Böhnke, S*. and Perner, M. (2018), Talk @ 17th international Symposium on Microbial Ecology. ISME17: An activity-based metagenomic screen reveals: RubisCO is not the only enzyme that converts ribulose-1,5-bisposphate (Leipzig, Germany).

*Vortragender Autor